к mp3 отношусь относительно сносно, т.к. стараюсь "делать" их лично. Единственная причина возни с конвертацией lossless - mp3 это экономия места при прослушивании музыки на флэш-плеере.
Формат некритичен.
Из-за возможных проблем с *.cue (не сегодня, так завтра) лучше потрековая сборка.